Od 1919 również był docentem na Uniwersytecie Jagiellońskim, od 1920 r. - członek korespondent Polski ej Akademii Umiejętności. Również należał do Towarzystwa Naukowego w Warszawie i Lwowie. Autor m.in. Pierwsza książka polska (1918) oraz Teatr, dramat i muzyka za Stanisława Augusta (1925). Na wieść o agresji ZSRR na Polskę, Ludwik Bernacki wraz z pracownikami Ossolineum zaczęli znosić do piwnic najcenniejsze zbiory. 19 września po dwóch dniach Bernacki zmarł na skutek olbrzymiego stresu i przemęczenia. Lwów był pod ciągłym ostrzałem artyleryjskim, dlatego został pochowany w ogrodach Ossolineum, pochówek miał być tymczasowy. Po ponad 70 latach starano się odnaleźć miejsce pochówku, lecz nie przyniosły one rezultatów.
Cykl powstaje przy współpracy z Instytutem Pamięci Narodowej